Ο Μόρσι, ειδικότερα, κατηγορείται για κατασκοπεία και προδοσία εις βάρους του κράτους, όπως επίσης και για συνεργασία με το Χαμάς.

Νωρίτερα ο Μόρσι βρισκόταν, κατά πάσα πιθανότητα, σε μια από τις στρατιωτικές εγκαταστάσεις στο Κάιρο.