Στα τέλη Μαρτίου του 2013, ο Μουσάραφ, για πρώτη φορά από την παραίτηση του, έφθασε στο Πακιστάν, παρά τις απειλές των Ταλιμπάν ότι θα αποπειραθούν να τον δολοφονήσουν. Κατέθεσε τα έγγραφα που απαιτούνται για να λάβει μέρος στις εκλογές, αλλά την Τρίτη το δικαστήριο του απαγόρευσε τη συμμετοχή, εξαιτίας παραβίασης του Συντάγματος το 2007.

Εναντίον του Μουσάραφ έχουν απαγγελθεί σειρά από κατηγορίες, μεταξύ των οποίων και για συνωμοσία με στόχο τη δολοφονία.